سونوگرافی ترانس واژینال سه بعدی (سونوگرافی زنان) جهت بررسی آنومالی ها و شکل های غیر طبیعی رحم که اغلب به صورت مادرزادی می‌باشد مورد استفاده قرار می‌گیرد. در این روش ناهنجاری‌های مادرزادی رحمی مانند رحم‌های سپتوم‌دار، رحم‌های دو شاخ ، رحم‌های تک شاخ و بد شکلی‌های حفره داخلی رحم به راحتی قابل بررسی و تشخیص می‌باشد. اینگونه آنومالی‌های رحمی از علل شایع سقط و زایمان‌های زودرس می‌باشند. از دیگر کاربردهای سونوگرافی سه بعدی بررسی پولیپ های رحمی می‌باشد. از دیگر علل شایع سقط و خون ریزی‌های غیر طبیــــعی ، وجود فیبـروم‌های رحمی و بــه ویژه فیبروم های متعدد رحمی می‌باشد. به همین ترتیب سونوگرافی سه بعدی داخلی (ترانس واژینال- سه بعدی) می تواند محل دقیق فیبروم‌های رحمی، به ویژه در موارد متعدد و گسترش این فیبروم ها را به حفره رحمی را مشخص نماید.